생물정보학(Bioinformatics)의 기본 정리입니다.

소개글

informatics를 처음 접하는 분에게 저장된 데이터를 어떻게 생명공학 측면에서 사용될 수 있는지를 간단히 설명하였습니다.

목차

1. 용어 및 개념 정리

2. Illumina Sequence Read

3. Sequence Alignment (진화를 고려한 DNA sequence의 배열)

4. Global, Pairwise Sequence Alignment
① Linear gap penalty를 적용
② Affine gap penalty를 적용

5. BLAST

6. Phylogenetics

7. Practice

본문내용

- Cell이란 Living Organism을 구성하는 Building block으로 Genetic Material의 중심 저장소인 Nucleus 여부에 따라 Eukaryotes와 Prokaryotes로 나뉨
- DNA는 4가지 Nucleotide로 구성된 Double stranded structure로 모든 Organism의 기능과 발달에 대한 유전정보를 보유하고 있음
- Genome이란 한 종이 가지고 있는 유전정보의 집합체를 말하며, 핵 안에 존재하는 DNA가 가지고 있는 모든 정보들을 의미한다. 즉, 한 cell에서 모든 Chromosome이 보유한 유전체 총량을 말한다.
→ 세포 안의 모든 유전자의 개수는 5만개, 모든 뉴클레오타이드의 개수는 3x10의 9승 = 3Gb
- Nucleosome이란 8개의 histone protein과 이를 감싸고 있는 DNA segment를 의미한다.
- Chromatin은 응축된 정도에 따라 heterochromatin과 Euchromatin으로 나뉘며, Nucleosome과 linker DNA로 구성된 Array를 의미
- Chromosome이란 Chromatin이 Condensed되어 Visible form이 된 상태를 의미하며 replication시 duplication chromsome이 되고, 그 중 Half를 chromatid라고 함
- Homologous chromosome이란, 모양과 크기가 비슷한 염색체로 maternal과 paternal로부터 온 chromosome의 구성을 말함
- Gene이란 유전 정보를 활용하여 Functional product를 형성하는 과정인 Gene expression에 참여하는 DNA region을 의미.
- Central dogma란 어떻게 Genomic information이 전달되는지 과정을 설명한 것으로 General Transfer의 경우, DNA는 DNA pol을 통해 replication을 진행하여..

<중 략>

참고 자료

없음