분자 마커
- 최초 등록일
- 2009.04.15
- 최종 저작일
- 2009.04
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소개글
분자마커란 종내 형질 다형성이 있는 DNA 좌위를 말한다. 형질 대형성은 DNA 절단 효소에의해 절단된 단편의 다형성을 보는 RFLP, Polymerase chain reaction을 통한 증폭 길이의 다형성을 보는 AFLP 등이 있다. 사용하는 곳은 유전자 지도를 작성하거나, 표현형과의 association study를 위해 사용한다. 이것을 응용하여, 질병 진단이나, 부성 판정등에 사용되고, 범인을 잡을때 사용될 수도 있다.
목차
1. 분자 마커란??
2. RFLP(restriction fragment length polymorphism)
3. AFLP(amplified fragment length polymorphism)marker
4. DNA chip
5. SNP(Single Nucleotide Polymorphism) marker
6. Protein chip
7. 참고문헌
본문내용
1. 분자 마커란??
분자마커란 종내 형질 다형성이 있는 DNA 좌위를 말한다. 형질 대형성은 DNA 절단 효소에의해 절단된 단편의 다형성을 보는 RFLP, Polymerase chain reaction을 통한 증폭 길이의 다형성을 보는 AFLP 등이 있다. 사용하는 곳은 유전자 지도를 작성하거나, 표현형과의 association study를 위해 사용한다. 이것을 응용하여, 질병 진단이나, 부성 판정등에 사용되고, 범인을 잡을때 사용될 수도 있다.
분자마커의 종류는 매우 다양하다. 그리고 그 다양성만큼이나 지니는 속성과 유용성 또한 다양하다. 이번 글부터 시리즈로 현재 진화유전학과 분자생태학에서 이용되고 있는 분자마커들을 열거하고 어떤 속성을 지니며, 어떻게 이용되고 있는지를 이야기하고자 한다. 먼저 분자마커는 그 유전되는 방식에 따라 양친유전(biparental inheritance)성 분자마커와 모계 또는 부계유전을 포함하는 단위유전(uniparental inheritance)성 분자마커로 구분할 수 있다. 대부분의 핵속에 들어있는 유전정보는 일반적인 양성생식 생물이라면 부모로부터 절반씩 물려받았기 때문에 양친유전성 분자마커로 활용될 수 있다. 이에 비해 미토콘드리아와 엽록체와 같이 세포질 내에 존재하는 세포소기관이 보유하고 있는 유전체(genome)가 지니고 있는 유전정보는 대부분 모계유전을 하고 인간의 Y염색체는 오로지 부계유전에 의존하여 유지되고 있다.
2. RFLP(restriction fragment length polymorphism)
RFLP marker 분석은 4~6개의 특정 DNA 염기서열을 인지하여 절단하는 제한효소를 이용, 비교 대상 개체의 전체 핵 DNA를 절단하고 이로부터 생기는 모든 DNA fragment를 크기 순으로 전기영동에 의해 분리하여 그 절단 양상(DNA band pattern)을 상호 비교하는 방법을 말한다.
RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)는 1980년 Bostein과 그의 동료들이 제한효소(Restriction endonuclease)의 가계지도를 작성하다가 처음 발견하였다. 이것은 특정부위의 점 돌연변이(point mutation)에 의해 제한효소로 절단하였을 때 생기는 절편들의 길이가 사람마다 다양하게 나타나는 DNA의 다형성이다. 사람의 게놈 내에서 단일 염기쌍의 변이는 상당히 빈번하여, 일부는 1000bp 중 한번 꼴로 나타난다. 이런 점 돌연변이는 제한효소가 인지하는 염기서열에 발생하여 제한효소의 인지부위가 새로 생성되거나 또는 현존하는 제한효소 인지부위가 소실되어 제한효소에 의한 DNA의 절편양상이 달라지고 이것은 전기영동을 통하여 쉽게 감지될 수 있는 것이다.
제한효소들은 몇 개의 특정 염기순서를 인지하여 그 안이나 부근에서 DNA의 이중나선을 가위가 실을 자르듯 절단한다. 예를 들어 Bgl II 는 AGATCT를 인지하여 A-G사이를 자른다. 그러므로 ACATCT → AGATCT로 점 돌연변이가 일어난다면 Bgl II 는 제한효소의 자리를 인지하여 DNA 단편을 절단한다.
참고 자료
● http://kin.search.naver.com/search.naver?sm=tab_hty&where=kin&query=Protein+chiP
● http://kin.search.naver.com/search.naver?sm=tab_hty&where=kin&query=DNA+CHIP
● http://kin.search.naver.com/search.naver?sm=tab_hty&where=kin&query=SNP
● http://kin.search.naver.com/search.naver?sm=tab_hty&where=kin&query=RFLP
● http://kin.search.naver.com/search.naver?sm=tab_hty&where=kin&query=AFLP