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단백질 구조 예측 소논문

*철*
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최초 등록일
2011.03.31
최종 저작일
2010.10
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소개글

[서울대 과학과 기술 글쓰기] 단백질 구조 예측

A4 16page 분량의 단백질 구조예측에 관한 연구 소논문입니다.

학부 고학년 수준의 연구 소논문 자료 입니다.

목차

개요‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥3

1.서론‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥3
2.아미노산과 단백질의 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥3
2.1.아미노산의 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥3
2.2.단백질의 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥4
2.2.1.단백질의 1차 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥4
2.2.2.단백질의 2차 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥5
2.2.3.단백질의 3차 구조‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥5
3.기존 연구의 분석‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥6
3.1.기존의 연구방법‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥6
3.2.기존 연구 방법의 문제점‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥6
4. 거리 측정법‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥7
4.1.기존의 거리측정법‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥7
4.1.1.자카드 거리‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥7
4.1.2.코사인 거리‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥7
4.1.3.편집 거리‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥8
4.2. 다중 편집 거리‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥8
5.아미노산 행렬과 구조예측‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥9
5.1.아미노산 행렬‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥9
5.2.구조예측 결과‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥ 10
6.결론‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥ 11
참고문헌‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥ 12
부록‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥‥ 13

본문내용

개요
생명 현상을 이해하는 것은 그것을 이루고 있는 단백질의 구조를 알면 용이하다. 단백질의
구조를 알면 기능을 예측하는데 큰 도움이 되기 때문이다.1) 때문에 단백질 구조 예측은 바
이오산업의 핵심 기술이라고도 할 수 있다. 현재 이 분야의 연구를 위해 여러 가지 방법들
이 논의되고 있다. 본 고에서는 비유클리드 공간상의 새로운 거리 측정 방법인 다중 편집
거리에 대해 소개하고, 그것을 이용하여 단백질의 1차 구조로부터 3차 구조를 예측하는 새
로운 단백질 구조 예측법을 제시하였다.
1.서론
단백질의 구조 예측은 생명 현상의 이해를 돕는다는 점에서 신약 개발 및 바이오시스템 개
발에서 핵심 역할을 한다. 또한 인간 게놈 프로젝트에 의해 인간 유전자의 염기 서열이 모
두 밝혀지면서 그 서열로부터 단백질의 구조를 예측하는 학문의 중요성이 부각되었다. 하지
만 2006년 8월까지 알려진 약 5천만개의 아미노산 서열 중에서 단백질의 구조가 밝혀진
것은 3만 8천여개뿐이다.2) 따라서 아미노산 서열로부터 구조를 예측하는 것은 단백질의 구
조를 밝히는데 크게 일조할 것이다. 하지만 현재까지는 단백질 구조 예측 프로그램이 미비
한 상태이며 사용되는 프로그램은 정확도가 높지 않은 실정이다. 따라서 새로운 단백질 구
조 예측 프로그램의 개발이 절실하다.
.
.
...

참고 자료

Campbell N. A., Mitchell L. G., Reece J. B., Biology: Concepts
Campbell N. A. & Reece J. B., Biology, (Pearson, Benjamin Cumings, 2005)
Collins F. S. et al., `New Goals for the US Human Genom Project: 1998-2003`, Science 282 (1998):5839
Fiser A., Do R. K., & Sali A.. Modeling of loops in protein structures, Protein Science 9. 1753-1773, 2000.
Hamming R. W., `Error detecting and error correcting codes`, Bell Syst. Tech. J 29 (1950):2
Henikoff S. & Henikoff J. G., `Amino Acid Substitution Matrices from Protein Blocks`, Proceedings of the National Academy of Science 89 (1992):22
Kreuzer Helen
Skolnick Jeffery et al., Structural genomics and its importance for gene function
analysis, vol.18, Nature Biotechnology, 2000.
Wagner R. A. & Fischer M. J., `The String-to-String Correction Problem`, Journal of the ACM (JMCA) 21 (1974):1
Zhang K. & Shasha D., `Simple fast algorithms for the editing distance between trees and related problems`, SIAM Journal on Computing 18 (1989):6
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