핵자기공명자료

목차

1. Backbone and sidechain assignment
2. STRUCTURE CALCULATION BY CYANA PROGRAM

본문내용

Basic platform to the peak assignment
Target 단백질이 가지고 있는 아미노산의 핵종에 대하여 Peak list를 만듬.

(Peak의 intensity결과값은 필요치 않음)

Assignment값을 standard로 하여 NOE peak을 찾음
(Peak의 intensity가 곧 distance의 정보가 됨으로 intensity를 필요로함.

<중 략>

Starting point를 잡을때 unique한 Carbon ppm 을 나타내는 amino acid를 잘 활용한다.
Example: Ala의 경우 Cb의 ppm이 10~18ppm 사이에 나온다
Ser, Thr의 경우 Cb의 ppm이 Ca보다 낮은 65~75ppm 사이에 나온다
Gly의 경우 2D HSQC 상에서 Nitrogen 쪽 ppm 이 105에서 115 근처에서 나온다.
Pro의 경우 amide proton이 없으므로 HSQC상에 peak이 나타나지 않는다.

참고 자료

없음