생물정보학 정리

목차

1. 용어정리
2. program
3.program 이용방법
4.BLOSUM과 PAM 숫자가 가지는 의미
5. Window size, Step size, Threshold
6.Sequence alignment가 무엇이며, 그러한 방법과 목적에 따라sequence alignment 종류를 구별 짓는다면 어떻게 지을 수 있는지, 그리고 궁극적으로 sequence alignment를 하는 이유가 무엇인지 기술하시오.
7. bioinfotmatics
8. Tandem repeat, Inverted repeat, Palindrome sequence/repeat Dot Plot
9.Dot matrix를 이용해서 서열정렬 할 경우의 기본 방법은 어떻게 되는가? 그리고 Dot matrix를 이용한 서열정렬 방법이 갖는 장점과 단점을 간략히 나열하시오.

본문내용

1.용어정리
-Contig : A contig is a set of overlapping DNA segments that together represent a consensus region of DNA (중복 부위를 갖는 DNA 단편들의 집합)
-Shotgen method : 유전자를 cloning할 때 어느 생물의 유전자 DNA전체를 제한 효소로써 절단하고 이것을 자기증식성의 vector DNA에 결합시켜 숙주 세포에 도입하여 그 DNA 단편을 증식시키는 방법
-Consensus sequence : 어떤 DNA영역에서 특정의 염기가 공통으로 고빈도로 출현하는 염기배열의 부위:
-Codon frequency : codon이 달라도 같은 아미노산을 지정, 유전자인 것과 아닌 것을 구별하는 척도

참고 자료

없음