[대학생물학실험] 생물정보학 실험

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목차

Ⅰ. 실험 목적
Ⅱ. 이론
Ⅲ. 방법
Ⅳ. 결과
Ⅴ. 고찰
Ⅵ. 참고문헌

본문내용

Ⅰ.실험목적
이 실험의 목적은 총 3가지로 나뉘게 된다. 먼저 생물정보학에 대해서 이해 하는 것이 그 첫째이다. 두 번째로NCBI의BLAST이 원리를 알고 이를 활용하여 주어진 염기서열의 동정을 구하는 것이다. 마지막으로 BLOSUM을 이용하여 아미노산 서열의 현재 유행하고 있는 코로나 바이러스가 어떤 바이러스와 그서열이 유사한지에 대해서 알아보는 것이다.

Ⅱ.이론
1. 생물정보학
생물정보학(bioinformatics)은 생명공학과 정보기술을 활용하여 생명체가 지닌 막대한 양의 정보를 수집, 저장, 분석, 가공하는 분야이다.

<중 략>

Ⅴ.고찰
1.BLAST실습과제
이번BLAST를 진행하면서 가장 두드러지게 나타나는특징은 2가지가 있다. word size조정에 따른 상이한 결과와 하나의 염기서열에서 여러 바이러스와 유사도가 높게 나온 것이다. 5개의 염기서열을 각각에 대해서고찰을 써보도록하겠다.

①의 염기서열의 경우는 word size가 28일 때에는 결과가 나오지 않았지만 20, 더 작은 size인 16에서 SARS ­ CoV와 Total 점수 80.5를 보여주었다. 일반적으로 SARS ­ CoV에 대한 일관성 있는 결과가 나왔기 때문에 ①의 염기서열이 SARS ­ CoV라는 것은 의심의 여지가 없다. 하지만 word size에 따라 결과의 유무가 달라졌으므로 이는 논의될 필요가 있다. BLAST의 데이터베이스와 비교를 할 때, word size라는 것은 비교할 염기서열의 개수를 정하는 것이다. 따라서 ①의 염기서열을 28개를 한 단위로 해서 비교를 해본 결과는 일치하는 것이 없었지만 20개, 16개를 단위로 비교하는 것에는 해당 서열과 일치하는 데이터가 존재한다는 것이다. 이를 통해 예상해 볼 수 있는 것은 ①의 염기서열에서 일치하는 염기서열의 값이 word size 28미만에서 20이상이라는 것이다.

참고 자료

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