인천대학교 나노바이오실험(1) Bioinformation

소개글

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목차

1. 실험 일시
2. 실험 목표
3. 이론
4. 실험방법
5. 실험 결과
6. 고찰
7. 출처

본문내용

1. 실험 목표: 웹기반 생물학 데이터 베이스를 이용하여 특정 유전자의 염기 서열과 단백질 정보, 제한효소 정보 등을 알 수 있다.

2. 이론
1. Bioinformatics :생물정보학, 바이오인포매틱스(bioinformatics)는 생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학 등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문이다. 전산 생물학의 연구 분야는 시스템즈 생물학과 중복되기도 한다. 주 연구 분야는 서열 정렬, 유전자 검색, 유전자 조합, 단백질 구조 정렬, 단백질 구조 예측, 유전자 발현의 예측, 단백질 간 상호작용, 진화모델 등 다양하다.

2. NCBI: 미국의 대표적 국가 생정보학 기관
NCBI의 Gene에서 target 유전자를 검색하고 FASTA를 클릭하면 sequence 정보를 얻을 수 있다. 또한 primer-BLAST 정보도 얻을 수 있다.

3. ORF: 분자유전학에서 오픈 리딩 프레임(open reading frame, ORF)은 mRNA로 전사되어 단백질이 될 가능성이 있는 염기서열들을 의미하며, 1. 어떤 ATG(AUG) 서열을 시작으로 보는지에 따라 2. 염기서열을 3개씩 코돈으로 묶을 때 어떻게 묶느냐에 따라 3. DNA의 반대편 strand의 염기서열에서 전사되는지에 따라 시작코돈과 종결코돈에 변화가 생기기 때문에, 열려있다고 한다. ORF는 mRNA로 전사될 가능성이 있는 염기서열들의 집합이므로, 실제로 mRNA로 전사되는지의 여부는 실험적으로 확인해야 한다. 전사 종결자 정지 지점은 열린 번역 틀 다음에 위치하는데, 만약 전사가 종결 코돈 전에 멈추게 되면, 번역과정 동안 불완전한 단백질이 만들어진다.

참고 자료

bioedit:https://bioedit.software.informer.com/7.2/
ORF :
https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%98%A4%ED%94%88_%EB%A6%AC%EB%94%A9_%ED%94%84%EB%A0%88%EC%9E%84
bioinformatics:
https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%83%9D%EB%AC%BC%EC%A0%95%EB%B3%B4%ED%95%99