[생물전산학, 생물정보학] AnnHyb의 기능과 활용방법
- 최초 등록일
- 2004.12.10
- 최종 저작일
- 2004.12
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소개글
등록한 자료는 생물전산학 및 생물정보학에서 다루는 AnnHyb 이라는 프로그램에 대한 소개와 사용법을 정리한 것입니다.
또한, 생화학 및 분자생물학, 생물학 실험에서 DNA work을 수행 할 때 매우 도움이 되는 프로그램으로 그 사용법을 잘 익혀 둔다면 유용할 것입니다.
목차
1. AnnHyb 이란?
2. AnnHyb의 menu option
(1) File menu
(2) Edit menu
(3) Oligo menu
(4) Sequence menu
(5) Multi-alignment menu
(6) Option menu
(7) Help menu
3. AnnHyb의 활용방법
(1) 새로운 oligonucleotides sequence 만들기
(2) 새로운 nucleotide sequence를 입력하고, 이를 활용하는 방법
① 제한효소 처리 부위 확인
② translate sequence 확인
③ reverse/complement sequence 만들기
④ ORF 찾기
⑤ 염기의 구성비율 확인
⑥ codon usage 확인
⑦ PCR product 확인
⑧ sequence melting point 확인
(3) sequence alignment에의 활용
4. 결론
본문내용
AnnHyb은 1997년에 비주얼 베이직으로 제작된 것이 시초이며, free software로서 누구나 제약 없이 사용 가능한 프로그램이다. 여기에는 DNA work을 수행하기 위한 여러 가지 편리한 도구들이 많이 포함 되어있고, 이를 활용하여 실험 수행 전에 미리 어느 정도의 결과를 얻어낼 수 있거나, 실험을 수행하는데 필요한 여러 가지 정보를 쉽게 알아낼 수 있다. 이는 DNA work을 수행하는 많은 사람들에게 유용한 프로그램임에 틀림이 없을 것이다.
AnnHyb은 oligonucleotides와 같은 nucleotide sequence나 longer sequence(200,000bp 이하)를 다루는데 도움을 주는 프로그램이다. 이 프로그램에는 format conversion, sequence viewer, sequence editor, oligonucleotides alignment, restriction analysis, pattern searching, retrieval from servers, multi-alignment viewer, consensus determination등의 기능을 쉽게 할 수 있는 도구들이 있다.
참고 자료
없음