[세포생물학]Synthesis of DNA probe

소개글

특정 병원체나 유전자를 검출 또는 동정하기 위한 DNA Probe는 수천 염기쌍의 크기로부터 인공적으로 합성한 짧은 단편에 이르기까지 다양하며 실험 목적에 따라 그 길이를 선택할 수 있다. 또한 Probe의 염기서열이나 표지방법도 목적에 따라 선택기준이 다르며 적절한 사용기준이 필요하다.
Probe란 우리말로 탐침자란 뜻으로 무엇인가 원하는 것을 찾아내는 역할을 하는 매개체를 가리키는 말이다.

목차

Ⅰ. Introduction.
1. DNA Probe.
2. 탐침의 제조.
* References.
Ⅱ. Material
Ⅲ. Method
Ⅳ. Discussion.
* References.

본문내용

특정 병원체나 유전자를 검출 또는 동정하기 위한 DNA Probe는 수천 염기쌍의 크기로부터 인공적으로 합성한 짧은 단편에 이르기까지 다양하며 실험 목적에 따라 그 길이를 선택할 수 있다. 또한 Probe의 염기서열이나 표지방법도 목적에 따라 선택기준이 다르며 적절한 사용기준이 필요하다.
Probe란 우리말로 탐침자란 뜻으로 무엇인가 원하는 것을 찾아내는 역할을 하는 매개체를 가리키는 말이다. 유전자의 클로닝과 분석의 모든 과정에서 핵산의 혼성화 반응(hybrization)을 통한 실험이 수행되는데, 단일가닥의 유전자와 hybrid를 형성하는 probe에는 방사성 동위원소가 표지되어 있어 X-ray film을 통해 신호를 감지할 수 있다. 이와 같은 실험 방법들의 성공 여부는 클로닝 DNA에 얼마나 효과적으로 방사선 동위원소를 표지하느냐에 달려있다고 할 수 있다.
DNA probe는 DNA chip, southern blotting 등에 사용되며, 기본적으로 염기서열을 알고 그 서열에 맞는 gene 등을 찾는 것이 목적이라 할 수가 있다. DNA 의 PCR에서 primer 대신으로 사용하기도 하며, 얻고자 하는 sequence를 찾는데, 형광표시물질을 삼입하여 이용하기도 한다.

1. DNA Probe.
짧은 단일가닥 DNA로서, 보통 10~1000 뉴클레오티드 길이의 올리고뉴클레오티드이며,상보적인 뉴클레오티드 서열을 지닌 핵산 분자를 탐지하기 위해 사용된다. 짧은 단일가닥 DNA는 비효소적인 방법으로 실험실에서 화학합성을 통해서 약 120 bp까지는 쉽게 만들어 낼 수 있다.
합성 DNA를 탐침으로 사용하는 경우 20~40 bp 정도 되는 것이 일반적으로 사용된다.길이가 길어질수록 안정적이지만 비용과 특이성을 고려하여 이 정도의 길이를 사용한다. 15bp 이하의 염기서열은 probe 또는primer로는 적당하지 않는데, 특이성을 design 할 때는 중심부에 1염기 또는 두세가지 다른 서열이 있으면 식별할 수 있을 정도로 고안하여야 한다. 그러나 혼성화 온도 조건을 엄격히 하지 않으면 안되기 때문에 일반적으로 3염기 이상의 차이가 있는 서열을 사용하여 반응조건 설정을 쉽게 한다. 서열에 따라서는 그 위치에 따라서 사용할 수 없는 것이 있다.

참고 자료

없음