<환경유전체학 실험> - Metagenome

소개글

<환경유전체학 실험> - Metagenome

목차

·Metagenome
·16s rRNA의 증폭?
·LacZ operon이란?
·IPTG를 넣는 이유?
·참고문헌

본문내용

·Metagenome
; 환경에 존재하는 모든 미생물의 genome을 모아놓은 것을 metagenome이라 한다.
과거에 미생물에 관한 연구에서는 특정 미생물을 순수배양 하여 하나의 미생물을 연구하는 방법을 써왔으나 순수배양 할 수 있는 미생물의 종류는 전체의 1%정도만을 배양할 수 있다는 단점이 있다. 이러한 순수배양의 문제점은 난배양미생물의 존재뿐 아니라 자연 환경 시료에 대한 미생물의 흡착력 차이로 인해 배양 자체가 불가능한 경우도 있을 수 있다. 대부분 실제 서식환경에서 미생물은 microcolony라는 집락을 이루며 동종간 혹은 이종간 상호작용을 통해 서식하는데 순수배양 기술은 이러한 서식환경으로 한 종류의 생물만을 인위적으로 분리하는 것이므로 미생물의 성질을 바꾸기도 한다. 이러한 성질의 변화는 미생물의 빠른 진화속도와 맞물려 실험실에서 배양과 계대가 장기화될 때 자연계에서와는 전혀 다른 성질을 가지는 방향으로 변화될 수도 있는데 내생포자형성를 형성하는 세균인 Bacillus subtilis의 예에서 이러한 사실이 증명되었다.
이런 점을 개선하기 위한 방법의 하나로 metagenome을 연구하고 있으며 이는 배양이 되지않는 미생물이나 알지 못하는 미생물을 연구하는 데 있어 효과적인 방법으로 16S rRNA (원핵생물, 미토콘드리아, 엽록체)와 18S rRNA (진핵생물)을 증폭하여 연기서열을 파악 계통생성 (phylogeny)과 분류 (taxonomy)의 좋은 척도로 사용되고 있다. 16S rRNA의 서열비교를 통한 계통분류학은 기존의 분류체계에 비해 미생물다양성을 부각시키는 데 결정적인 역할을 하였고 이를 통해 특정한 분류군의 미생물이 자연계에 존재하는지를 생물을 배양하지 않고도 알아볼 수 있다.
·16s rRNA의 증폭?
; 16S rRNA란 16S rDNA의 전사물질로 보다 정확하게는 Small subunit Ribosome의 구성체이다. Ribosome은 DNA에서 RNA로 전사가 되고 단랙질로 발현되는 과정에서 단백질을 합성하는 세포내 소기관이다.

참고 자료

www.naver.com
http://www.kosen21.org
http://biozine.kribb.re.kr