cDNA Microarray의 이해

소개글

cDNA Microarray의 개요와 chip의 제작, 실험방법, 이미지 분석, 데이타 획득과 의미있는 데이터 분석에 이르기까지 microarray를 이해하기 위한 ppt 발표자료로 구성되어 있음

목차

cDNA microarray의 개요
cDNA microarray의 제작
cDNA chip hybridization
Image Analysis
Data processing
Data Mining

본문내용

*NA chip의 개요
Genome project 수행으로 수많은 유전적 정보를 효율적으로 해석하기 위한 실험기법이 필요
1995년 Stanford U. 에서 처음 개발하여 사용
Slide glass와 같은 작은 고형체 위에 수백 ~수십만의 유전자를 정렬·고정화한 것
Probe의 크기에 따라 cDNA chip과 oligonucleotide chip으로 나뉨

*Normalization method
Global normalization
: chip에 array된 전체 유전자 signal 강도를 이용한 보정
Housekeeping gene normalization
: housekeeping gene의 signal 강도를 이용한 보정
External control normalization
: 농도를 알고있는 외부 표준물질을 sample에 동일량 첨가하고 labeling 한 후 양자의 signal 강도를 보정

참고 자료

DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)
SOURCE(http://genome-www5.stanford. edu/cgi-bin/source/sourceSearch)
KEGG(http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html)
GenMapp(http://www.genmapp.org/)
Biocarta(http://www.biocarta.com/)
Himap(http://www.himap.org/index.jsp)
Affymetrix(http://www.affymetrix.com/index.affx)
GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/geo/)