"BLOSUM" 검색결과 1-20 / 28건

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  BLAST를 이용한 바이러스의 동정 및 BLOSUM 분석을 활용한 아미노산 서열 관찰

  이 결과는 기본 옵션인 BLOSUM62를 이용하였다. ... BLOSUM30으로 바꾸면 Bat-RaTG12와의 유사성 변화는 없고, Pangolin(천산갑)-CoV와의 유사성은 BLOSUM62를 이용했을 때와 동일한 98.3%이다. ... 거리가 먼 단백질 친족이라는 것을 뜻한다.참고문헌: 위키피디아, BLOSUM Hyperlink "https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM" https://

  리포트 | 3페이지 | 1,000원 | 등록일 2020.09.17

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  [일반생물학실험]생명정보학 실습

  BLOSUM 실습과제1) Bat-RaTG12BLOSUM 62BLOSUM 90BLOSUM 302) Pangolin(천산갑)-CoBLOSUM 62BLOSUM 90BLOSUM 303) Human-SARS-CoVBLOSUM ... 62BLOSUM 90BLOSUM 304) Bat-SARS-CoV-relatedBLOSUM 62BLOSUM 90BLOSUM 305. ... .50~60BLOSUM 62가장 통상적으로 사용하며 서열 유사성이 타당한지의 유무를 판단할 때 사용한다.30~40BLOSUM 30긴 서열에서 많이 먼 유연관계임에도 불구하고 유사성을

  리포트 | 6페이지 | 2,500원 | 등록일 2022.06.17

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  아주대학교 생물학실험1 7주차 생물정보학 실습 보고서 만점입니다

  유사성 찾고 싶을 때 사용.BLOSUM62: 통상적으로 쓰이는 BLOSUM 점수 행렬.BLOSUM30: 아주 먼 관계임에도 불구하고 유사성을 제시해보고자 할 때 사용.원리첫번째 아미노산의 ... BLOSUM 옆의 숫자는 점수 행렬의 종류를 나타내는 것으로 BLOSUM30은 아주 먼 관계의 유전자 사이의 유사성을 제시해보고자 할 때 사용하고, BLOSUM62는 통상적으로 쓰이는 ... 세 점수 행렬의 Score들을 비교해봤을 때 BLOSUM62

  리포트 | 11페이지 | 2,000원 | 등록일 2022.01.29

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  생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트

  Blosum 분석 툴에 비교하고자 하는 두 아미노산 서열을 입력하여 blosum62/90/30의 세 조건에서 유사성을 비교했다. 기본 옵션은 blosum62이었다. ... 53/59, 89.8%BLOSUM90: similarity 53/59, 89.8%BLOSUM30: similarity 53/59, 89.8%2) Pangolin(천산갑)-CoV아미노산 ... 이는 BLOSUM62의 기준에서 측정한 값들로 판단한 결과이다.

  리포트 | 13페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.06.29

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  생물 정보학 리포트

  유사성을 비교하는 BLOSUM matrix를 기본 옵션인 BLOSUM62가 아닌 BLOSUM90과 BLOSUM30으로 바꿨을 때 결과는 어떻게 달라지는가? ... 이 과정에서 BLAST와 BLOSUM을 이용하여 실습을 해보도록 한다.실험 결과1). BLAST 실습 과제(1). ... BLOSUM 실습 과제(1). 위 표의 첫 번째 서열은 현재 전 세계적으로 유행하고 있는 코로나바이러스의 아미노산 서열 일부를 가져온 것이다.

  리포트 | 10페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.07.08

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  아주대 생명과학실험 생물정보학 실습

  아닌 BLOSUM30, BLOSUM90으로 옵션을 변경 시 결과는 어떻게 달라지나요? ... 예를 들어, BLOSUM80은 밀접한 정렬에 사용되고, BLOSUM45는 더 먼 관련 정렬에 사용된다.BLOSUM 매트릭스는 생물정보학 연구에서 중요한 도구로, 단백질의 진화적 관계와 ... 숫자가 높은 BLOSUM 행렬은 밀접하게 관련된 시퀀스를 비교하기 위해 설계된 반면, 숫자가 낮은 BLOSUM 행렬은 더 먼 관련 시퀀스를 비교하기 위해 설계되었다.

  리포트 | 14페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.04.15

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  [아주대 생명과학실험] 생물정보학 실험 보고서

  (More options… 배너를 클릭해 BLOSUM matrix 와 같은 옵션을 재설정할 수 있다.)4.2 Multiple sequence alignment(Clustal Omega ... 실습BLOSUM 90 matrix를 이용하여 주어진 오리너구리의 PTPN4 유전자 일부와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 종은 무엇인지 보고서에 작성오리너구리의 PTPN4 유전자 ... 따라서 BLOSUM에서는 바늘두더지와 오리너구리가 100% 일치했지만(발췌한 서열에서는 일치) 전체 서열을 비교했을 때는 0.00536(0.01487-0.00951)의 오차가 나는

  리포트 | 21페이지 | 1,500원 | 등록일 2022.08.30 | 수정일 2022.09.01

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  아주대학교 생물학실험1 세포정보학 실험 결과보고서

  .- BLOSUM 점수행렬을 활용하여 코로나바이러스와 높은 유사성을 지닌 바이러스를 알아본다.2. ... BLOSUM 점수행렬에서 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우(유사도가 높음)을 의미하며, 음의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀌지 않을 경우를 의미한다. ... 이 값은 sequence 데이터베이스 크기에 따라 다르며 시퀀스 길이에 비례한다. 3) BLOSUM(Blocks Substitution Matrix): 아미노산 서열을 정리하는 알고리즘

  리포트 | 7페이지 | 2,500원 | 등록일 2020.12.17 | 수정일 2020.12.19

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  생물정보학 정리

  ≒ BLOSUM 점수↓5. ... : 60% identical=BLOSUM 60 , 80% identical=BLOSUM 80*점수 높음= 적용하는 룰이 엄격하다, mutation 일어나지 않는다.⇒ PAM 점수 ↑ ... *BLOSUM(Blocks Amino Acid Substitution Matrices)-BLOSUM 60 : 사용한 sequence의 similary 60이상-Consensuce formed

  리포트 | 3페이지 | 1,500원 | 등록일 2020.12.10

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  생물학실험1_생물 정보학

  그러면, BLOSUM80과 BLOSUM45는 어떤 차이가 있을까? ... 그에 반해, BLOSUM80은 매우 비슷한 단백질들을 찾는 데 효용성이 있을 것이라고 예측할 수 있다. ... 그러므로, BLOSUM45는 진화적 거리가 먼 단백질 친족을 찾을 때 사용하면 더 좋을 결과를 가져온다.

  리포트 | 14페이지 | 2,000원 | 등록일 2023.02.25

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  아주대 생물학실험1 결과보고서 [7주차 생물 정보학] (점수 10/10, 에이쁠)

  BLOSUM(1) BLOSUM의 정의 : 생물정보학에 BLOSUM은 BLOcks Substitution Matrix의 약자이다. ... 점수가 높을수록 상동성이 더 있다고 해석할 수 있다.(2)BLOSUM Matrix의 종류와 용도Matrix용도Similarity(%)BLOSUM 90서로 정말 비슷한 서열의 유사성을 ... .50~60%BLOSUM 62가장 통상적으로 사용하며 서열 유사성이 타당한지의 유무를 판단할 때 사용한다.30~40%BLOSUM 30긴 서열에서 많이 먼 유연관계임에도 불구하고 유사성을

  리포트 | 25페이지 | 2,000원 | 등록일 2024.01.30

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  단백질 서열 분석 보고서

  바이러스임을 알 수 있다.유사성을 비교하는 BLOSUM matrix를 기본 옵션인 BLOSUM62가 아닌 BLOSUM90과 BLOSUM30으로 바꿨을 때 결과는 약간의 변화는 있지만 ... matrix를 기본 옵션인 BLOSUM62가 아닌 BLOSUM90과 BLOSUM30으로 바꿨을 때 결과는 크게 차이가 없다.7. ... BLOSUM62는 62%의 서열 동일성을 가진 다중 서열 정렬에서 아미노산들의 치환을 계산해 내서 만든 것이며 BLOSUM Matrix의 숫자가 작아질수록 서열의 퍼센트 동일성이 낮다는

  리포트 | 8페이지 | 1,000원 | 등록일 2020.11.25

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  [아주대] 생물학실험1 생명정보학 보고서 A0

  또한 BLOSUM62가 아닌 BLOSUM90으로 바꿨을 때 유사성이 줄어드는 경향을 보였고 BLOSUM30으로 바꿨을 때는 더 다양하게 동종되는 것을 볼 수 있었다. ... [구글 위키백과] BLAST, BLOSUM 검색 ... 또 다른 분석방법으로 BLOSUM(Blocks Substitution Matrix)이 있는데 BLOSUM은 블록처럼 틈이 없는 서열정렬에서 아미노산들의 치환 정도를 정리한 행렬표를

  리포트 | 9페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.01.14

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  아주대 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서

  실험결과1) BLAST 실습과제2) BLOSUM- BLOSUM 62- BLOSUM 90- BLOSUM 306. ... 점수와 유사성이 가장 높기 때문에 천산갑 코로나 바이러스가 가장 유사한 아미노산 서열이라고 할 수 있다.BLOSUM 62를 기본값으로 두고 BLOSUM 90과 BLOSUM 30으로 ... BULSOM 숫자가 작아질수록 유사성 퍼센트가 커짐.② BLOSUM 점수 행렬4.

  리포트 | 13페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.12.28

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  아주대 생물학실험 1 생물정보학실습

  .50~60BLOSUM 62가장 통상적으로 사용하며 서열 유사성이 타당한지의 유무를 판단할 때 사용한다.30~40BLOSUM 30긴 서열에서 많이 먼 유연관계임에도 불구하고 유사성을 ... 블로섬을 만드는 데 쓰이는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라, 단어의 끝에 숫자를 붙인다.① BLOSUM 점수 행렬Matrix사용할 때Similarity(%)BLOSUM ... 서열의 길이가 짧지만 그 내에서도 다른 점을 찾고 싶을 때 이용한다.70~90BLOSUM 80BLOSUM 90을 이용한 서열보다는 긴 서열이고 그 내에서 유사성을 찾고 싶을 때 사용한다

  리포트 | 12페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.03.18

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  생물정보학 실험 보고서(아주대학교 생명과학실험 A+ 보고서)

  매트릭스로써, 매우 유사하며 짧은 서열을 비교할 때 사용하는 BLOSUM 90, BLOSUM 90에 사용하는 것보단 조금 더 길지만 유사성이 비슷할 때 사용하는 BLOSUM 80, ... 그리고 BLOSUM62에서 BLOSUM90으로 바꿨을 때의 결과는 유전자 서열 중 비교하는 길이가 짧아져서 유사성이 같거나 커지는 결과를 얻을 수 있었고, 이와 반대로 BLOSUM62에서 ... CoV의 BLOSUM90임을 알 수 있었다.

  리포트 | 14페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.01.05 | 수정일 2023.10.23

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  아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습

  BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. ... BLOSUM을 이용하면 단백질 서열 간의 유사도를 비교 분석할 수 있다. score가 높을수록 상동 일치 관계(homology)가 더 있다고 볼 수 있다. ... , https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM위키피디아, 다중서열정렬, https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%8B%A4%EC%A4%91%

  리포트 | 5페이지 | 1,000원 | 등록일 2024.04.04

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  생물정보학 결과보고서

  있다 BLAST 알고리즘은 이러한 도메인 또는 더 짧은 서열 유사성을 찾기 위해 알고리즘이 설정되어 있다 블라스트의 종류는 크게 뉴클레오타이드 단백질 번역 게놈 타입으로 나뉜다2) BLOSUM ... 단백질의 서열 정렬에 사용되는 치환 행렬이다한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성 즉 두 아미노산의 유사성을 나타내며 아미노산 사이 생물학적 화학적 관계를 반영해 점수를 매긴다 BLOSUM

  리포트 | 14페이지 | 1,000원 | 등록일 2023.11.13

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  아주대학교 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서

  BLAST 클릭BLOSUM 사용법1. EMBOSS NEEDLE 사이트 접속2. 각각의 아미노산 서열 입력3. 옵션 설정하기 (90)4. Submit 클릭5. 실험 결과1. ... BLOSUM 실습과제오리너구리 – 사람 비교 결과오리너구리 – 바늘 두더지 비교 결과오리너구리 – 개 비교 결과오리너구리 – 주머니 쥐 비교 결과오리너구리 – 닭 비교 결과3. ... 다섯 번째 코드는 실험 결과에서 볼 수 있듯이 word size가 16, 32에서 가장 높은 유사도로 Homo sapiens로 해석된다.두 번째 실험으로 BLOSUM을 이용해 5가지

  리포트 | 15페이지 | 1,500원 | 등록일 2023.01.14

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  생물정보학 보고서

  4종이 나왔는데, 이들은 공통적으로 영장류에 속한다. 4번 서열이 영장류들의 공통 서열임을 예측할 수 있고, 어떤 종을 대표하기엔 염기 서열이 짧아 여러 종이 나온 것으로 생각된다.BLOSUM ... 가시두더지4번AGGATTACCCGCCAGCTCACGCCGCGCAGTGCGCTTTTCCGCTCCTCGCGCCCCACCACC결과 : 여러 종 동시 (사람, 침팬치, 오랑우탄, 고릴라 )[ 사람 ][ 침팬치 ][ 오랑우탄 ][ 고릴라 ]BLOSUM

  리포트 | 4페이지 | 1,500원 | 등록일 2023.07.20

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